新華社上海8月31日電(記者 羅爭光)如何可靠地檢測新近發(fā)生的自然選擇?記者31日從中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院計算生物學(xué)研究所了解到,李海鵬研究員的最新研究成果,圓了這個理論群體遺傳學(xué)界20年來的夢想。
研究人員介紹說,在生命的進化過程中,達爾文的自然選擇是一種重要的進化力量,它使得攜帶某個突變的個體相對于不攜帶這個突變的個體來說有生存和繁殖上的優(yōu)勢。它不僅在野生群體和現(xiàn)代人類的進化過程中扮演著重要的角色,而且在家養(yǎng)動植物(如稻米、狗和豬)的培育及馴化過程中均起著決定性的作用。通過留在生物體基因組里的關(guān)于自然選擇事件的“蛛絲馬跡”,我們可以研究這些基因突變的功能,并最終探索進化的根本奧秘——適應(yīng)性進化的分子生物學(xué)機制。
目前在檢測自然選擇事件的時候,一個關(guān)鍵的研究障礙在于,需要事先估計出研究對象長期進化過程中群體數(shù)量的變化,以提高自然選擇檢驗的可信度。然而,即使采用目前的在基因組水平上遺傳多態(tài)數(shù)據(jù)的分析方法,仍然難以精確估計出分析過程中具體的假陽性率,因而也就難以提高相關(guān)研究的精確度。
在過去20多年里,理論群體遺傳學(xué)研究的一個主要目標,就是要建立一個行之有效的方法,使得檢測新近發(fā)生的自然選擇不受群體數(shù)量變化的影響。李海鵬的研究成果將這一夢想變成了現(xiàn)實。
據(jù)介紹,李海鵬提出了一種全新的通過檢驗樹的拓撲結(jié)構(gòu)策略來檢測新近發(fā)生的自然選擇,并建立了相應(yīng)的統(tǒng)計學(xué)方法。數(shù)學(xué)和計算機模擬兩方面均證明,該統(tǒng)計學(xué)假設(shè)檢驗的結(jié)果不受群體歷史數(shù)量變動的影響。這意味著無論群體的數(shù)量在歷史上如何變動,這一新方法的假陽性率將保持在統(tǒng)計學(xué)假設(shè)檢驗時所設(shè)的顯著性水平以下。
而且,新的方法不需要任何種群歷史的信息或者對種群參數(shù)的估計,也無需基因組水平的遺傳多態(tài)數(shù)據(jù),僅僅需要來自于一個DNA片段的遺傳多態(tài)數(shù)據(jù),就可以可靠地檢測新近發(fā)生的自然選擇。
目前,這一研究成果已經(jīng)發(fā)表在影響因子為9.872的MBE(Molecular Biology and Evolution)雜志上。